Na skuteczność działania bakterii mają wpływ warunki pogodowe. Przy niekorzystnych warunkach pogodowych, głównie przy silnym nasłonecznieniu musimy powstrzymać się od stosowania bakterii gdyż promieniowanie UV ma zły wpływ na mikroorganizmy. Zalecamy również ostrożność w łączeniu bakterii z fungicydami. W preparatach znajdują się pożyteczne grzyby, więc dodatkowo nasuwa się pytanie po co łączyć je z fungicydami, skoro one je w jakimś sensie zastępują i nie są szkodliwe.
Nie stosuje się także bakterii w warunkach silnych opadów deszczu. Poza tym nie ma ograniczeń. To nieszkodliwe dla środowiska preparaty. Jedynym ograniczeniem jest ekonomia. Technologia ta wymaga cierpliwości i zmiany paradygmatu myślowego, szukaniu ukrytych dochodów w gospodarstwie.